«Тюрьма Алькатрас была официально закрыта, а все заключенные были переведены с острова», именно это сказали миру в 1963 году. Однако это было ложью, на самом деле при загадочных обстоятельствах исчезли все заключенные и персонал тюрьмы, но на этом всё не закончилось. Спустя 49 лет после этих событий люди, пропавшие без вести, начинают появляться также внезапно, как и исчезли. Где они были всё это время, почему появились именно сейчас? Это и предстоит выяснить главным героям сериала Алькатрас.